טכניקת המדיטציה הטרנסנדנטלית אינה כוללת ריכוז, מניפולציה מנטלית, אוטוסוגסטיה או הכוונה מחשבתית. שיטה זאת אינה קשורה למיינדפולנס או לדמיון מודרך.
ההבדל העיקרי בן המדיטציה הטרנסנדנטלית לשיטות מדיטציה אחרות טמון בעצם השם שלה. פרוש המילה "טרנסנדנטלי" הוא "מעבר", כלומר מדובר בשיטה שמאפשרת לנו לעבור בטבעיות וללא מאמץ מעבר לכל פעילות מנטלית ולחוות מצב תודעה רביעי שבו אנו ערים לחלוטין ויחד עם זאת חווים מצב עמוק של מנוחה. המדענים קראו למצב זה בשם ערנות נינוחה וטענו שהוא שונה לחלוטין משלושת מצבי התודעה הרגילים שאנו חווים בחיים (ערנות, שינה וחלימה).
מחקרים מדעיים על שיטות מדיטציה שונות הראו שבעת תרגול המדיטציה הטרנסנדנטלית נוצרים שינוים בגלי מוח, שיפורים בבריאות הלב והפחתה ברמת חרדה ששונים בצורה ברורה מתוצאות שהושגו בשיטות מדיטציה אחרות.